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通过对19个木莲属树种的花粉进行扫描电子显微镜观察拍照，观察描述花粉的形态学特征，测量花粉极轴与赤道轴长度、花粉表面孔穴和突起的密度并据此进行聚类分析。扫描电子显微镜下形态学观察结果表明：木莲属19个种的花粉均为舟形，且具有长及两端的远极萌发单沟等一致特征，花粉表面孔穴、突起等特征在种内部比较稳定，不同种之间差异明显，具有一定的分类学意义，但作为属下分类依据需慎重。聚类分析结果表明：相同地区或分布地域相近的树种花粉特征更相近，证明的遗传分枝与地理分布有很强的相关性。