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以环状异帽藻（Heterocapsa circularisquama）ITS1区为靶序列设计了一对特异性引物，运用Real-timePCR方法，对环状异帽藻进行了定性定量检测。以其他9种赤潮微藻为对照验证其特异性。结果表明，仅含环状异帽藻DNA模板的样品有扩增，其他藻没有检测到扩增信号。以超声波破碎得到的藻液为标准品，所得标准曲线具有高度线性相关，相关系数R^2为0．989，并且可以在30个循环内检测到0．5个细胞。对在不同培养条件下获得的环状异帽藻DNA样品进行检测，都能获得扩增信号。利用该方法建立的标