志贺氏菌CRISPR位点的比较基因组学及与质粒数量的相关性分析

来源 :中国食品学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：fulinbo

【摘要】

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成簇规律间隔的短回文重复序列(CRISPR)在多数细菌和古生菌中广泛存在,该遗传结构可以有效防御外源DNA(如质粒、噬菌体等)的侵袭,从而降低外源基因的水平转移。本文的研究对

【作者】

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曲道峰陆诗铫陈跃文黄东萍龚俏玲易松强韩剑众

【机构】

：

浙江工商大学食品与生物工程学院,江西省畜牧技术推广站

【出处】

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中国食品学报

【发表日期】

：

2020年5期

【关键词】

：

志贺氏菌 CRISPR 间隔区外源基因质粒 ShigellaCRISPRspacerexogenous geneplasmid

【基金项目】

：

浙江省科技计划项目(2017C32036),食品科学与工程浙江省重中之重一级学科项目(2017SICR118)

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成簇规律间隔的短回文重复序列(CRISPR)在多数细菌和古生菌中广泛存在,该遗传结构可以有效防御外源DNA(如质粒、噬菌体等)的侵袭,从而降低外源基因的水平转移。本文的研究对象为志贺氏菌属中的鲍氏志贺氏菌、痢疾志贺氏菌、宋内氏志贺氏菌以及福氏志贺氏菌等40株菌。研究不同志贺氏菌种中CRISPR位点的结构差异,其与可移动质粒之间的关联。采用生物信息学的方法比较间隔序列与插入序列的同源性,判断CRISPR位点与RNA二级结构稳定性的关系。结果:40株志贺氏菌中均含CRISPR结构,共有241个CRISPR位点

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