【摘 要】
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[目的]基于槟榔黄化病毒的RNA依赖性RNA聚合酶筛选抗槟榔黄化病毒先导化合物.[方法]使用基于片段的药物设计方法,从PADFrag农药分子片段子库中筛选出14个片段作为骨架进行生长,得到140个分子,取11个CDOCKER得分靠前的分子进行分子动力学模拟和MM/GBSA计算以评估这些分子与RNA依赖性RNA聚合酶的亲和力,最后确定2个优选分子作为潜在的抗槟榔黄化病毒先导化合物.[结果]2个优选分子能以范德华力、静电相互作用以及氢键等方式与靶点稳固结合,有潜在的抗槟榔黄化病毒活性.[结论]2个优选分子可作
【机 构】
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海南省农业科学院植物保护研究所,农业农村部海口作物有害生物科学观测实验站,海南省植物病虫害防控重点实验室,海口571100
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[目的]基于槟榔黄化病毒的RNA依赖性RNA聚合酶筛选抗槟榔黄化病毒先导化合物.[方法]使用基于片段的药物设计方法,从PADFrag农药分子片段子库中筛选出14个片段作为骨架进行生长,得到140个分子,取11个CDOCKER得分靠前的分子进行分子动力学模拟和MM/GBSA计算以评估这些分子与RNA依赖性RNA聚合酶的亲和力,最后确定2个优选分子作为潜在的抗槟榔黄化病毒先导化合物.[结果]2个优选分子能以范德华力、静电相互作用以及氢键等方式与靶点稳固结合,有潜在的抗槟榔黄化病毒活性.[结论]2个优选分子可作为先导化合物用于新型抗槟榔黄化病毒药物开发.
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