拉伸分子动力学相关论文
为了方便、直观地研究氯离子通道膜蛋白内部氯离子输运过程的动力学性质,利用全原子分子动力学模拟方法对大肠杆菌氯离子通道膜蛋白......
2019年12月由新型肺炎冠状病毒(SARS-Co V-2)感染导致的肺炎(COVID-19)疫情大规模爆发,并于2020年3月被世界卫生组织宣布为全球大流行.......
多环芳烃(PAH)被认为是火焰中碳烟生成的前驱体之一,PAH的物理凝结在碳烟生成过程非常重要。利用拉伸分子动力学(SMD),我们计......
随着石油资源的枯竭和人类对能源增长的需求,寻找廉价,清洁的可再生能源已成为全球研究人员的共同目标。同时,纤维素作为植物细胞......
采用拉伸分子动力学方法研究了单壁碳纳米管(8,8)在室温下从硅基板上被剥离的过程.当碳纳米管(CNT)在硅基底上被剥离时,剥离距离和......
在HIV-1的生活周期中,有三种酶对其至关重要。这三种酶分别是蛋白酶(protease),逆转录酶(reverse transcriptase),以及整合酶(integra......
目的 研究cADPR从CD38活性口袋解离的过程中配体和受体间的相互作用,并寻找接近真实条件的蛋白结构模型.方法 采用拉伸分子动力学......
TCR识别MHC提呈的抗原肽具有高灵敏性和特异性,识别过程中存在结构和能量的变化。精确计算大分子体系的自由能面临非常多的困难。一......
吸附、沉积、聚集是大自然当中存在的物理现象。微纳尺度有机发光小分子定位沉积形成的图案在众多领域有广泛的应用,因此表面图案......
配体和受体之间的相互作用研究有助于阐明配体的作用机理,为合理药物设计提供线索.新发展的拉伸分子动力学模拟使原来在微秒至秒时......
恢复蛋白Recovedn是一重要的神经钙传感蛋白.为澄清EF-hand与Ca2+耦合/去耦合作用机制,采用拉伸分子动力学(SMD)方法对其进行了一......
采用拉伸分子动力学方法研究聚乙烯单链在真空中从一个强吸附表面被拉伸的动力学过程.当聚乙烯单链从中间1/3处被拉伸时,通过理想......
采用拉伸分子动力学方法(steered molecular dynamics,SMD)研究一端固定的聚乙烯单链(single polyethylene chain)在被拉伸过程中的力学......
采用拉伸分子动力学方法研究聚乙烯单链从一个强吸附表面被拉伸的动力学过程。当聚乙烯单链被拉伸时,从理想弹簧测量到的平均力〈f......
丝蛋白纤维材料是具有普适意义的天然生物材料,具有优良的生物相容性、生物可降解性、低炎症反应和优秀的机械性能。文章通过分子模......
采用平衡分子动力学和拉伸分子动力学模拟方法研究了模板诱导有机发光小分子3(5)-(9-蒽基)吡唑(ANP)在自组装膜上的选择性沉积,并利用伞......
本文利用同源模建、分子对接、分子动力学等方法,对人类肺表面活性蛋白D(hSP-D)、人类胞外信号调节激酶1(hERK1)和人类碳酸酐酶VII......
Discovery Studio是BIOVIA公司研发的一款药物发现计算模拟平台。在Discovery Studio 2017中新增拉伸分子动力学模块,拉伸分子动力......
自从20世纪70年代,分子动力学模拟首次在蛋白质分子应用以来,尤其在生物科学领域变得越来越普遍。它提供了一种用计算机在原子水平......
提出一种基于路径优化的非平衡自由能预测方法。首先,通过建立蛋白质复合物解离的多目标优化模型找出一条能耗小、速度快的拉伸分子......
Hsc70与auxilin蛋白组成的系统是Hsp70/Hsp40分子伴侣系统家族的一员,在热休克反应中发挥重要作用。本文为得出auxilin蛋白J结构域......
分子伴侣Hsp40是一种以二聚体的形式调控非天然多肽折叠的热激蛋白。本文通过拉伸分子动力学研究了酵母Hsp40家族成员Ydj1p二聚体......
血管内皮生长因子受体-2作为血管内皮生长因子促进血管生成的主要受体,与多种疾病如糖尿病性视网膜病变、风湿性关节炎、肿瘤等密......
蛋白质分子动态模拟最常用的方法是分子动力学模拟。在过去二十年中,分子动力学模拟的算法及其在生物大分子中的应用都有很大的发......
采用拉伸分子动力学方法(Steered Molecular Dynamics)和蒙特卡洛方法(Monte Carlo)相结合,研究了吸附在表面附近的聚乙烯单链的构象及......