【摘 要】
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本研究分析比较了新发现的鸭病毒性肠炎病毒（Duck Enteritis Virus DEV) dUTPase基因（登录号DQ486149）和32 种参考疱疹病毒dUTPase 基因序列的密码子使用偏爱性。结果表明DEV dUTPase 基因编码蛋白长为477个氨基酸链，其中包括五个以3-1-2-4-5为排列顺序的保守基序。CAI，ENC，GC3S 值表明疱疹病毒dUTPase同义密码子的使用呈偏爱
【机 构】
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四川农业大学动物医学院禽病防治研究中心, 雅安, 625014 四川农业大学动物医学院禽病防治研究
【出 处】
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中国畜牧兽医学会动物传染病学分会教学专业委员会第六届第12次学术研讨会
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本研究分析比较了新发现的鸭病毒性肠炎病毒（Duck Enteritis Virus DEV) dUTPase基因（登录号DQ486149）和32 种参考疱疹病毒dUTPase 基因序列的密码子使用偏爱性。结果表明DEV dUTPase 基因编码蛋白长为477个氨基酸链，其中包括五个以3-1-2-4-5为排列顺序的保守基序。CAI，ENC，GC3S 值表明疱疹病毒dUTPase同义密码子的使用呈偏爱性，与基因的宿主进化相关。DEV dUTPase基因密码子使用模式具有同源进化保守性，相似于禽类α疱疹病毒。不同生物物种的疱疹病毒dUTPase 基因密码子使用偏爱性各异，但不存在种属特异性。61种密码子使用在预测的多肽，第3位密码子强烈偏向于A和T。DEV dUTPase基因与大肠杆菌、酵母及人3种密码子使用频率差值较大的大肠杆菌有19个，酵母有16个，人有15个。方差分析显示DEV dUTPase基因密码子与酵母差异极显著(r=0.536，P<0.01)。DEV dUTPase基因的密码子使用偏爱性程度与基因表达水平有高度相关性，为基因分类地位的确定和功能研究提供有用数据。
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定量检测肠炎沙门氏菌（SE）不同途径感染雏鸭后消化道内葡萄球菌属的动态变化规律。鸭源肠炎沙门氏菌（SE）经口服、滴鼻和皮下注射感染7日龄雏鸭后，运用TaqMan探针实时荧光定量PCR（FQ-PCR）对SE感染后30min、1h、2h、4h、8h、12h、24h、36h、48h、72h、6d、9d无菌采集的每1cm十二指肠、空肠、回肠、盲肠和直肠各肠段内葡萄球菌属DNA拷贝数（以对数值表示）进行检测
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