后疫情时代,国际环境日益复杂,各国间的战略博弈加剧,全球产业链、供应链面临深入调整,科技竞争在经济增长和社会变革的过程中不容忽视,科技创新已成为衡量国家核心竞争力的核心指标。然而,科技创新是一个复杂的过程,面临许多不确定性,单纯依靠市场调节难以实现创新资源的优化配置,因此政府的作用也提到了首位,需要出台相关发挥科技创新的导向和规制作用的政策法规。中国自由贸易试验区肩负着制度创新的核心使命,近些年通过先行先试进行制度创新,持续释放了许多政策红利,已形成制度创新的高地。科技创新需要破除体制机制障碍,提供良好的制度供给和制度环境,而自由贸易试验区的核心是制度创新,科技创新与制度创新存在着联动关系。在此背景下研究自由贸易试验区建设对我国区域科技创新具有重要意义。本文采用2011-2018年间中国30个省份的面板数据,通过政策量化方法构建自由贸易试验区建设,利用固定效应模型实证分析自由贸易试验区建设对区域科技创新的影响,并运用中介效应模型进一步识别自由贸易试验区建设对区域科技创新的作用机制,得出以下结论:（1）自由贸易试验区建设对区域科技创新具有显著的促进作用,提高了区域科技创新的数量与质量。（2）自由贸易试验区人才引育、科技金融和配套服务政策对区域科技创新的促进作用强于知识产权保护、财政支持和创新激励政策,且存在政策滞后性。（3）自由贸易试验区建设会通过升级产业结构、优化资源配置等途径促进区域科技创新。（4）自由贸易试验区建设对区域科技创新存在地区差异,东部地区自由贸易试验区建设对区域科技创新的促进作用强于中西部地区。基于研究结果,本文从三个方面给出了相应建议:（1）完善自由贸易试验区创新政策,提供保障机制促进集成落地。（2）注重问题导向,采取差异化制度创新方式。（3）优化产业布局,助力区域协同发展。