无创产前DNA检测应用于基因组拷贝数变异的临床诊断意义

来源 :广州医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:haicang
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以往研究表明,基因组拷贝数变异(Copy Number Variation,CNV)在某些人类表型变异或疾病中起重要作用,有些综合征,如猫叫综合征,Williams-Beuren综合征,Charcot-Marie-Tooth综合征,Angelman/Prader-Willi综合征等,是染色体片段重复/缺失引起。大部分的CNV存在基因多态性,而只有少数有致病性的变化。以往CNV的诊断主要依赖于染色体 G显带核型分析或荧光原位杂交技术(fluorescence in situ hybridization,FISH),基于染色体微阵列的比较基因组杂交(array-based comparative genomic hybridization,aCGH)的出现,大大加快了拷贝数变异在人类基因组的发现。但是,这些方法作为传统的产前诊断程序,为确诊遗传畸变,必须采取侵入性操作,这将导致流产、宫内感染、胎盘后血肿等并发症,增加患者思想负担,因此人们迫切希望一种无创检测方法的诞生。直到1997年,当胎儿游离DNA(cell-free fetal DNA, cfDNA)在孕妇血浆中的发现促进了非侵入性产前诊断的发展,无创产前DNA检测(Non-invasive Prenatal Testing,NIPT)不仅可以准确预测一些常见的胎儿非整倍体,如13,18,和21三体和性染色体异常,还可以预测染色体拷贝数变异胎儿。但是,目前国内外尚未有 NIPT应用于胎儿 CNV的大样本临床报道,本研究在国内率先探讨了NIPT对染色体微缺失/微重复产前筛查的可行性。  目的:  1.1.探讨NIPT对染色体拷贝数变异(CNV)产前筛查的准确性。  1.2.探讨NIPT在染色体微缺失/微重复产前筛查中的应用价值。  1.3.探讨NIPT联合染色体G显带、aCGH技术,对提高微缺失/微重复综合征胎儿检出率的意义。  对象与方法:  研究对象:  选取2014年10月到2015年10月期间,采用知情选择的原则,在深圳市第二人民医院及深圳市其他医院自愿参与NIPT检测的孕妇14235例,患者年龄21-42岁,平均年龄31.4岁。纳入标准孕龄12-24周,单胎,排除标准孕妇本人为染色体异常患者、孕妇接受过移植手术及干细胞治疗、孕妇在四周之内接受过免疫治疗、孕妇在一年内输注过异体血制品。  方法:  1.收集14235例母血浆样本4℃保存,在深圳市华大基因公司进行NIPT检测。  2.对NIPT检测发现染色体拷贝数变异(CNV)并同意行进一步产前诊断的孕妇行羊水穿刺,应用染色体核型分析及 Array-CGH技术对检测结果进一步验证,从而评估 NIPT筛查胎儿 CNV的准确性,必要时对孕妇及其丈夫进行染色体核型分析及Array-CGH技术检测以确定CNV的来源,综合评估CNV的致病性及胎儿预后。  3.随访引产胎儿行尸检,继续妊娠者追踪妊娠过程及新生儿结局。  结果:  1.在14235份进行NIPT检测的样本中,筛查出18例21三体、4例18三体、2例13三体(符合率均为100%),还筛查出24例CNV。  2.NIPT筛查出的24例CNV,15例(微重复11例,微缺失4例)同意进一步行产前诊断,2例经过染色体核型分析及aCGH技术验证为假阳性,7例经染色体核型分析及aCGH技术验证为阳性,6例aCGH技术验证为阳性,而染色体核型分析未见异常,6例CNV源自父母,7例CNV是新发变异,3例胎儿引产,1例引产后胎儿尸检见房间隔缺损。  3.NIPT筛查CNV的片段大小在NIPT筛查出的24例CNV中,<5M的CNV为4例(26.7%),<10M的CNV为7例(46.7%),≥10M的CNV为8例(53.3%)。  结论:  NIPT作为一种筛查手段,对筛查CNV的准确性较高,具有很好的前景,但因技术尚未完善,目前更多是一种提示的作用,尚未达到产前诊断能力。
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