中医药文化源远流长,是古代先贤思想智慧、文化传统与医疗经验的融合。随着我国对中医药传承与创新的支持,中药受到了更广泛的关注。中药中的物质基础研究,是对中药药效及药理作用科学化理解的关键,是中药现代化研究的主要内容之一。本论文从中药材中较常见、用量较大的四味药材金银花、甘草、板蓝根和苦杏仁出发,通过数据库比对的筛选方法进行了单方药材的成分分析。并对以上述四种中药材为主要原料的两种市售中药口服液的活性物质进行成分比较,通过统计学分析、数据库比对等筛选方法,初步获得了两种中药口服液中的差异信息,并通过补充数据库、考察中药原始配方差异的方式,完成了复方提取物的差异研究,为中药配伍及炮制过程的优化提供了新的技术思路。首先,针对现有数据库的局限性,本论文以黄酮类化合物为基础,利用文献调研以及糖苷结合的方法建立结构数据库,涵盖共2304种化合物结构,包括已有报道结构1649种,衍生推导结构655种。并基于该数据库建立了中药提取物中化学成分的检索方法。其次采用17种不同种类的黄酮类化合物标准品混合溶液对液相分离条件进行优化,其中包括黄酮醇、黄酮烷、二氢黄酮、异黄酮以及查尔酮类化合物,该17种化合物的结构以及液相保留情况均差异较大。并选择最优分离条件使得分离效果符合定性分析要求。同时利用该17种化合物对所建数据库进行验证,经验证发现,自建数据库及分析参数的设置可以协助准确定性和判断混合溶液中化合物组成。利用该检索方法对单方中药材进行了成分分析,并完成了初步溯源,其中发掘出四种新型黄酮类化合物结构。本论文基于多元变量统计学建立了显著性差异标志物的筛选方法,并利用该方法对所选取的两种市售中药口服液进行分析。首先通过前处理比较,选择了直接进样的检测方式,该检测方式减少了过程误差。其次通过统计学分析结果对比发现活性物质在不同配伍条件下存在明显的提取率差异。同时,通过差异标志物的筛选发现了多种差异物质。最后,本文结合化合物快速鉴定方法及显著性差异标志物的筛选方法,针对所选取的两种市售中药口服液中四种中药材相关活性物质提取率差异较大的问题,比对了该四种中药材与石膏配伍前后复方提取物成分差异。通过溯源分析,发现配方中的石膏成分对甘草和金银花来源的活性成分影响较大,石膏的存在可以大幅提升绿原酸等金银花来源活性成分的提取率,而同时抑制甘草皂苷等甘草来源活性成分的溶出。为深入研究中药生石膏中其他物质在药材提取中的作用,选用相同分析方法,加入硫酸钙作为对照进行药材提取,最终确认中药生石膏中的其他物质对活性成分的提取效果影响甚微。该分析方法综合利用了液质分析技术、自建化合物数据库资源及统计分析手段,为中药配方的研究提供了新的研究思路和技术支持。