规模化鸭场鸭圆环病毒流行病学调查及流行毒株测序分析

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鸭圆环病毒(DuCV)属于圆环病毒科(Circoviriae)圆环病毒属(Circovvirus),DuCV可导致鸭受到长期免疫抑制,使其他病原感染的几率升高,鸭疫病防控成本的增加,对鸭养殖业造成巨大损失。为了解新疆和田地区规模化鸭场DuCV感染情况,本研究使用PCR检测方法,对新疆和田地区规模化鸭场DuCV感染情况做初步调查,并对DuCV流行毒株全基因进行核苷酸序列测定及分析,明确和田地区规模化鸭场DuCV流行毒株。主要研究内容及结果如下:1.新疆和田地区规模化鸭场鸭圆环病毒流行病学调查2020-2021年间从我国新疆和田地区5个规模化鸭场采集临床有羽毛凌乱、生长发育迟缓症状的650只病、死鸭样本,采用PCR方法对鸭组织进行检测,鸭的来源一致。结果显示5个规模化鸭场采集的病、死鸭中DuCV群体阳性感染率为100%(5/5),个体阳性感染率为25.23%(164/650)。此外,DuCV阳性鸭中感染DHV的占比为15.2%。试验结果表明新疆和田地区规模化鸭场普遍存在DuCV的感染,且存在DuCV与DHV混合感染情况。2.鸭圆环病毒的全基因序列测序及序列分析。对5个规模化鸭场中DuCV阳性样本随机选取阳性样本进行全基因组扩增,扩增出2株DuCV全基因组序列,分别命名为DuCV HT-1、DuCV HT-2。测序结果显示:DuCV HT-1、DuCV HT-2全基因序列大小均为1993nt,根据全基因序列绘制的进化树显示2株DuCV均为DuCV-1a型,基因序列发现主要有6个开放阅读框,对主要的2个开放阅读框Rep、Cap的序列、氨基酸与DuCV1型参考株对比显示,Cap基因序列及氨基酸均有不同程度的变异,变异程度远高于Rep基因的序列及氨基酸。
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