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目的:
通过对维生素D受体和IL-10基因单核苷酸多态性与汉族人群慢性牙周炎和2型糖尿病易感性的关系的研究,进一步探讨慢性牙周炎与2型糖尿病的共同遗传背景。
方法:
收集107例重度慢性牙周炎患者、121名牙周健康对照者、64例单纯2型糖尿病患者(VDR基因组为64例,IL-10基因组为68例)及96例2型慢性牙周炎伴2型糖尿病患者的颊粘膜拭子,以Chelex-100法提取DNA,采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法测定VDR基因BsmⅠ、ApaⅠ、TaqⅠ、FokⅠ位点和IL-10基因-1082G/A、-819C/T、-592C/A位点的基因型,分析各疾病组与对照组间基因型、等位基因频率和单倍体频率分布的差异。
结果:
1.VDR BsmⅠ、TaqⅠ、ApaⅠ和FokⅠSNPs检测结果及Hardy-Weinberg平衡检验
VDR BsmⅠ、TaqⅠ、ApaⅠ和FokⅠ各位点PCR产物经相应的限制性内切酶酶切后读取基因型。随机抽取10%的样本,重复检测基因型结果与前完全一致。各位点基因型经PCR产物测序证实与前完全一致。四组资料的基因型频率分布符合Hardy-Weinberg平衡定律(p>0.05)。
2.VDR基因型和等位基因在不同组别分布频率比较
VDR基因BsmⅠ、TaqⅠ、ApaⅠ和FokⅠ位点基因型和等位基因分布频率在四组间差异均无统计学意义(P>0.05)。其中,TaqⅠ位点在四组受检者中基因型分布均以TT纯合子为主,Tt杂合子较少,tt纯合子分别在CP组和DM组中各有一例。BsmⅠ位点在四组受检者中均未发现BB基因型,以bb纯合子占较大比例,Bb杂合子较少。
对四组资料进行性别分层统计,结果显示,VDR基因BsmⅠ、TaqⅠ、ApaⅠ和FokⅠ位点基因型和等位基因分布频率在四组间差异均无统计学意义(P>0.05)。
3.VDR基因各位点间在不同组别的连锁不平衡分析
在2型糖尿病组和健康对照组中BsmⅠ和TaqⅠ位点间、在牙周炎伴2型糖尿病组和健康对照组中BsmⅠ和ApaⅠ位点间均存在较强的连锁不平衡(D>0.5)。
4.VDR基因BsmⅠ、TaqⅠ和ApaⅠ位点间在不同组别的单倍体型分析
在慢性牙周炎组和健康对照组中,单倍体BTA的频率分布差异有统计学意义,X2=4.219,P=0.040,OR值为4.066,95%CI=0.960~17.231。在2型糖尿病组和健康对照组中,单倍体Bta的分布差异有统计学意义。单倍体btA仅在对照组中出现,且差异有统计学意义。在牙周炎伴2型糖尿病组和健康对照组中,单倍体btA亦仅在对照组中出现,且差异有统计学意义。在后两组中其总的P值均<0.05。
5.IL-10-1082 G/A、-819 C/T和-592 C/A SNP检测结果及Hardy-Weinberg平衡检验
IL-10-1082 G/A、-819 C/T和-592 C/A各位点PCR产物经相应的限制性内切酶酶切后读取基因型。随机抽取10%的样本,重复检测基因型结果与前完全一致。各位点基因型经PCR产物测序证实与前完全一致。四组资料的基因型频率分布符合Hardy-Weinberg平衡定律(p>0.05)。
6.IL-10基因型和等位基因在不同组别分布频率比较
IL-10基因启动子区-592 C/A位点基因型分布在四组间无统计学差异(X2=9.505,P=0.147),等位基因频率在四组间比较有统计学差异(X2=8.620,P=0.035),进一步两两比较,DP组与对照组间,等位基因频率分布差异有统计学意义(X2=5.742,P=0.017),A等位基因相对于C等位基因OR(95%CI):=1.692(1.098~2.604)。CP组与对照组,DM组与对照组比较差异均无统计学意义,P>0.017.
-1082 G/A位点和-819 C/T位点基因型和等位基因在四组间的分布频率差异均无统计学意义。-1082 G/A位点在四组资料中均未发现GG基因型。基因型以AA纯合子为主,AG杂合子较少。
对四组资料进行性别分层统计,结果显示,在女性受检者中,IL-10基因启动子区-592 C/A位点基因型分布在四组间无统计学差异(X2=8.546,P=0.201),等位基因频率在四组间比较有统计学差异(X2=8.051,P=0.045),进一步两两比较,DP组与对照组比较,等位基因频率分布差异有统计学意义(X2=6.144,P=0.013),A等位基因相对于C等位基因OR(95%CI):=2.049(1.155~3.636)。CP组与对照组,DM组与对照组比较差异均无统计学意义(P>0.017)。-1082 G/A位点和-819C/T位点基因型和等位基因四组间比较无统计学差异。男性受检者中,各位点基因型和等位基因分布在四组间差异均无统计学意义(P>0.05)
7.IL-10基因各位点间在不同组别的连锁不平衡分析
IL-10基因启动子区-1082 G/A、-819 C/T和-592 C/A位点在各组间均存在较强的连锁不平衡(D=1.0)。
8.IL-10基因-1082-819-592位点间在不同组别的单倍体型分析
在2型糖尿病组和健康对照组中,单倍体ATA和ATC的频率分布差异有统计学意义(X2=5.688,P=0.017和X2=7.976,P=0.0048),单倍体ATA在2型糖尿病组中频率高于健康对照组。而单倍体ATC则在健康对照组中频率明显高于2型糖尿病组。两组间总的P值为0.017,差异有统计学意义。
在慢性牙周炎伴有2型糖尿病组和健康对照组中,单倍体ATA和ATC的频率分布趋势同2型糖尿病组和健康对照组间相似:单倍体ATA和ATC的频率分布差异有统计学意义,(X2=7.962,P=0.0048和X2=10.659,P=0.0011),单倍体ATA在慢性牙周炎伴有2型糖尿病组中频率高于健康对照组。而单倍体ATC则在健康对照组中频率明显高于疾病组。两组间总的P值为0.0025,差异有统计学意义。
在慢性牙周炎和健康对照组中,各单倍体型的频率分布在两组中差异无统计学意义。
结论:
1.与汉族人群慢性牙周炎遗传易感性相关的因素有:VDR BTA单倍体型。
2.与汉族人群2型糖尿病的遗传易感性相关的因素有:VDR Bta单倍体型;IL-10单倍体ATA。
3.与汉族人群牙周炎伴有2型糖尿病的遗传易感性相关的因素有:IL-10基因启动子区-592 C/A位点A等位基因;单倍体ATA。
4.VDR基因单倍体btA和IL-10基因单倍体ATC可能是汉族人群2型糖尿病和牙周炎伴有2型糖尿病患者的保护因子。