本文首先从高校科技成果转化基本问题入手,探究了高校科技成果转化的概念、方式、奖励政策以及各转化方式下具体的转化路径,阐述了各具体转化路径的不同与其在具体实践中遇到的问题,解释了目前高校无论采取技术转让还是技术入股方式进行技术成果转化都普遍采取通过高校资产管理公司进行科技成果转化的原因,并以此种路径作为进行后续税收问题研究的对象。第二章首先介绍了税收构成要件的一般原理,并以此对技术转让、技术入股方式下,各主体的纳税义务进行分析,并从分析中提出了技术转让模式下高校资产管理公司增值税问题、技术转让模式下科技成果完成人取得现金奖励的所得税分类问题、技术入股模式下高校资产管理公司增值税问题以及技术入股模式下技术成果完成人取得股权奖励所得税问题。第三章主要对上述问题按税种进行分类后具体分析并提出相应的观点。第四章主要从税收法律原则的角度,提出高校科技成果转化税收法律应贯穿税收中性原则。并以此提出平衡技术入股、技术转让方式下的税负与不应因在转化过程中增加没有经济实质的高校资产管理公司而增加科技成果转化整体税负的观点。并提出对于应通过修改财税字【1999】45号文和国税发【1999】125号文这两项税收优惠政策适用的税收主体的方式解决全局问题,再通过将增值税免征政策改为先征后退的方式,让高校能够切实地享受到增值税的税收优惠政策。