基于网络药理学及细胞实验探究定悸复脉汤治疗心房颤动的分子机制

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第一部分基于网络药理学探究定悸复脉汤治疗心房颤动的分子机制目的:心房颤动是目前最常见的心律失常之一,而定悸复脉汤是临床上用于治疗心律失常安全有效的传统中药复方。然而,对定悸复脉汤治疗心房颤动的活性成分和潜在机制的探索仍存在空缺,本研究拟通过网络药理学研究方法,初步探究定悸复脉汤治疗房颤的分子机制。方法:从中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP,中医药百科全书数据库(The Encyclopedia of Traditional Chinese Medicine,ETCM)和文献中收集定悸复脉汤的成分。然后,从Pub Chem平台获取每个成分的化学结构。接下来,使用Swiss ADME和Swiss Target Prediction对每个成分进行筛选和靶蛋白预测。同时,从Drug Bank、TTD、Malacards、TCMSP和OMIM数据库收集房颤治疗相关靶点。使用STRING平台构建蛋白互作网络,使用Cytoscape3.8.0构建药物-成分-靶点-疾病网络同时优化蛋白互作网络。使用Cyto NCA筛选核心基因,使用Var Elect分析靶点与疾病之间的关联度,并使用Funrich对核心基因相关的Mi RNA进行分析。最后,通过Metascape平台对GO和KEGG进行富集分析,并使用Auto Dock Vina进行分子对接以验证关联性和实现可视化。结果:定悸复脉汤具有168个生物活性成分,1093个对应靶点,定悸复脉汤的作用靶点和房颤治疗相关靶点之间共有89个共同靶点。H-C-T-D网络显示了定悸复脉汤、活性化合物、靶点和房颤之间的关系。从蛋白互作网络中提取了定悸复脉汤的三个蛋白功能模块。进一步的生物信息学分析表明,对氧化应激、炎症反应以及心肌离子通路的调节是定悸复脉汤治疗房颤的潜在作用机制。最后,分子对接验证了活性化合物与靶标之间的相互作用结论:通过网络药理学和分子对接结果得知,定悸复脉汤能通过各生物活性成分和靶蛋白之间的复杂相互作用,对房颤起治疗作用。促进了定悸复脉汤治疗房颤在分子机制层面上的解释,并为进一步的实验验证提供了系统化的思路。第二部分定悸复脉汤治疗氧化应激HL-1心肌细胞模型的试验研究目的:本研究第一部分基于网络药理学研究方法得出关于定悸复脉汤能够通过调节e NOS,IL-6,ACE,SIRT1,KCNH2,VCAM1,CAPS3,TGF-β1等核心靶蛋白治疗心房颤动的结论,本部分拟对网络药理学的结论进行验证,在HL-1细胞中探究定悸复脉汤是否能够调节以上靶蛋白。方法:制备定悸复脉汤冻干粉,使用CCK8方法,检测各浓度梯度下的定悸复脉汤,H2O2以及定悸复脉汤联合H2O2对HL-1心肌细胞增殖的影响,选择适宜浓度进行干预,随后,分别提取总RNA、培养上清和总蛋白,使用Real-time PCR(RT-PCR)分别检测KCNH2,ACE,SIRT1,ENOS,IL6,以及VCAM1的m RNA表达,用免疫酶联反应(Elisa)检测ACE,SIRT1,ENOS,IL6,以及VCAM1的表达,用蛋白印迹法(Western bloting)测定e NOS,IL-6,以及KCNH2蛋白的表达水平,同时,使用Hochest 33342对HL-1心肌细胞进行荧光染色,检测凋亡水平。结果:成功制备定悸复脉汤中药复方冻干粉,CCK8检测结果提示DFD在0-1g/L浓度时对细胞的增殖作用无统计学意义,H2O2在700μm时使细胞增殖减少50%,PCR结果表明,定悸复脉汤能够降低H2O2导致的ACE,VCAM-1和IL-6升高,以及升高H2O2导致的e NOS,SIRT-1降低,ELISA结果表明,定悸复脉汤能够降低H2O2导致的ACE,VCAM-1和IL-6的升高,以及升高H2O2导致的e NOS,SIRT-1降低,此外,在WB结果中,同样表明定悸复脉汤能够下调氧化应激细胞模型的IL-6,以及升高氧化应激细胞模型的e NOS和KCNH2。Hochest 33342染色结果表明,定悸复脉汤对H2O2导致的细胞凋亡具有修复作用。结论:定悸复脉汤对H2O2导致的细胞凋亡具有保护作用,能够下调氧化应激心肌细胞的ACE,VCAM-1和IL-6的表达,且能以及升高的KCNH2,SIRT1和e NOS的表达,对氧化应激细胞模型具有治疗作用。
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