【摘 要】
：
背景及目的:呼吸道合胞病毒（respiratory syncytial virus,RSV）是引起5岁以下儿童急性下呼吸道感染住院的最常见病原体。黏附蛋白（attachment protein,G蛋白）能够介导病毒的黏附及产生中和抗体,是RSV变异最大的蛋白。通过分析重庆地区RSV G基因变异情况,了解RSV病毒特性,为疫苗、单克隆抗体的研制提供分子流行病学数据。方法:收集2009年6月至2019
【基金项目】
：
国家科技重大专项（2018ZX10713002-002-007,2017ZX10103010-003）； 重庆市渝中区基础研究与前沿探索项目（20200153）；
论文部分内容阅读
背景及目的:呼吸道合胞病毒（respiratory syncytial virus,RSV）是引起5岁以下儿童急性下呼吸道感染住院的最常见病原体。黏附蛋白（attachment protein,G蛋白）能够介导病毒的黏附及产生中和抗体,是RSV变异最大的蛋白。通过分析重庆地区RSV G基因变异情况,了解RSV病毒特性,为疫苗、单克隆抗体的研制提供分子流行病学数据。方法:收集2009年6月至2019年12月因呼吸道疾病在重庆医科大学附属儿童医院呼吸中心住院患儿的鼻咽抽吸物（NPAs）,进行呼吸道病毒检测分型后扩增RSV G基因,并采用Seq Man、MEGA 7.0、Beast 1.10.4等软件分析序列的变异情况。结果:共收集并检测NPAs 8230份,RSV检出2624例（31.88%）,其中RSV-A检出1548例（18.81%）,RSV-B检出1042例（12.66%）,RSV-A、RSV-B合并检出34例（0.41%）。RSV A、B亚型交替流行,单一RSV-A检出患儿发热的发生率、中性粒细胞比例、C反应蛋白升高的发生率高于RSV-B（P<0.001,P=0.008,P=0.023）;单一RSV-B检出患儿呼吸困难的发生率高于RSV-A（P=0.009）。成功扩增450条RSV-A G基因,有6种基因型:GA1（1例,0.22%）、GA5（2例,0.44%）、NA1（119例,26.44%）、NA3（3例,0.67%）、NA4（3例,0.67%）和ON1（322例,71.56%）,其中ON1基因型替代NA1成为主要基因型。重庆地区RSV-A G基因的进化速率为6.704×10-3核苷酸/位点/年,ON1基因型的最近共同祖先的时间（the most recent common ancestor,TMRCA）为2009年。ON1基因型中,优势株存在T113I、V131D、N178G、H258Q和H266L氨基酸替换。特别的是,N178G位于G基因的中央保守区,是RSV G单克隆抗体bnm Abs3D3、bnm Abs2D10、CB002.5、CB017.5以及p VAX1/3G 148-198重组DNA疫苗等高度保守的抗原靶点中的变异,且在流行株中广泛存在。此外,几乎绝对保守的CX3C基序上存在1例W183L氨基酸替换。单一ON1检出患儿C反应蛋白升高、重症下呼吸道感染的发生率高于NA1（P=0.013,P=0.025）;而咳痰的发生率低于NA1（P=0.018）。感染突变株的患儿呼吸困难的发生率更低（P<0.001）。成功扩增428例RSV-B G基因,有4种基因型:GB3（1例,0.23%）、GB4（1例,0.23%）、GB5（15例,3.50%）和BA9（411例,96.03%）,其中BA9基因型取代GB5成为主要基因型。RSV-B G基因的进化速率为7.933×10-3核苷酸/位点/年,BA9基因型的TMRCA为2000年。BA9基因型中,优势株存在A131T和T137I氨基酸替换,A131T获得O-糖基化位点,T137I丢失O-糖基化位点。在单克隆抗体和疫苗抗原靶点中,RSV-B的氨基酸替换较RSV-A更多,但仅发生在少数序列中,而RSV-B中存在159-160位氨基酸（PK）的缺失发生在所有BA9基因型中。RSV-B CX3C基序中也是183位点存在变异（K183R）。单一BA9检出患儿与单一GB5检出临床特征无统计学差异,感染D215Y+L286P+A303P突变株的患儿血红蛋白高于未发生突变组（P=0.031）。结论:2009-2019年重庆地区RSV A、B亚型交替流行,两者临床特征具有差异。ON1基因型和BA9基因型分别成为RSV A、B亚型主要基因型。RSV G基因高变区及保守区均有变异发生,且部分变异影响疾病严重程度,因此需进一步研究RSV G基因变异对病毒致病性及潜在疫苗、单克隆抗体的影响。
其他文献
目的:分析颈部淋巴结转移与声门上型喉癌（supraglottic laryngeal carcinoma,SGLC）侵犯部位,以及临床病理特征之间的关系,为提高声门上型喉癌颈部淋巴结转移的预测能力提供一些有参考价值的资料。方法:对2011年1月至2017年12月期间就诊于重庆医科大学附属第一医院耳鼻咽喉科初始接受手术治疗的91例声门上型喉癌患者的临床病历及随访资料进行回顾性分析。T1期且颈部无危险
第一部分Mst1和WASp共同调控调节性T细胞外周稳态及抑制功能目的:以哺乳动物不育系20样激酶1（Mst1）基因敲除（Mst1KO）、Wiskott-Aldrich综合征蛋白（WASp）基因敲除（WASpKO）、Mst1-WASp双敲除（DKO）和野生型模型小鼠为研究对象,探究Mst1和WASp共同作用在调节性T细胞（Treg）中的影响及可能的机制。方法:在胸腺和脾脏中,通过流式技术检测T细胞各
雷诺综合征（Raynaud’s syndrome,RS）是指供应肢端的血液循环受阻时出现的一组症候群,经常是许多结缔组织疾病（Connective tissue disease,CTD）的首发症状,并且预示病情严重,因此早期诊断非常必要。RS归属于中医“血痹”、“寒厥”等范畴。目前,对于RS的治疗,国内外对此研究报道甚少。无论中医还是西医治疗,都只是经验之谈,尚无特效药,也无确切的诊治标准及权威的
放射治疗是癌症综合治疗的一种重要方式。目前光子是局部晚期直肠癌主流的放射治疗粒子束。但光子束所具有的物理特性使得较大部分危及器官不可避免的暴露于辐射中,导致危及器官急慢性毒副反应发生率较高,这不仅限制了病人肿瘤治疗的依从性,同时也降低了患者治疗后的生活质量。近年来包括质子及碳离子在内的重粒子束放射治疗技术发展迅速,重粒子束具备的优越物理及生物特性,使得重粒子束放射治疗在降低危及器官急慢性毒副反应发
目的:探讨Kisspeptin在来曲唑（letrozole,以下简称LE）诱导排卵下的多囊卵巢综合征（Polycystic ovary syndrome,PCOS）患者月经周期中的表达规律,同时探究月经周期中不同时间点Kisspeptin水平与促排卵妊娠结局的关联性。方法:前瞻性收集2020年05月—2020年12月于重庆医科大学附属第一医院生殖医学中心就诊的PCOS女性患者,均予以LE促排卵治疗
目的:探讨膜联蛋白A1（ANXA1）在下咽癌淋巴结转移中的表达,分析其与下咽癌患者的临床病理特征之间的关系和患者预后之间的关系,研究ANXA1在Fa Du细胞中的生物功能,并初步探讨ANXA1在下咽癌淋巴结转移中的作用机制。方法:通过对3例淋巴结转移和3例淋巴结未转移患者的下咽鳞状细胞癌组织标本进行RNA测序得到了差异表达基因（DEm RNAs）;采用q RT-PCR和Western blotti
背景:作为一种发病于鼻咽上皮的癌症,鼻咽癌发病机理相对复杂,尚不完全清楚。有趣的是,鼻咽癌好发于我国的南部地区,每年每100,000人口中有25-50例。其次是北非和地中海盆地。相比之下,在欧洲和美国,2012年的发病率仅为每10万人中0.4例。原发性鼻咽癌对放疗（RT）的反应高度敏感,如果及早发现,可以治愈。然而,放疗可能会引起放射线抵抗,从而导致治疗失败和NPC转移。因此,有必要进一步探索NP
目的:针对糖尿病肾病的机制研究,观察高糖刺激对人肾小球系膜细胞（human glomerular mesangial cells,HMCs）A类清道夫受体（scavenger receptor-A,SR-A）表达的影响,并初步探讨SR-A介导HMCs在高糖环境下发生炎症损伤的相关机制。方法:将体外培养的HMC按照其培养基中D-葡萄糖浓度分为正常糖组（normal glucose,NG）和高糖组（h
目的:EB病毒（Epstein-Ban Virus,EBV）属于人类疱疹病毒之一,其在人群中的感染率可达90%以上,但是在患者体内大多数是潜伏感染,没有引起明显临床症状。EBV主要嗜B淋巴细胞,与大多数B细胞淋巴瘤的发生和发展有一定关系,比如:霍奇金淋巴瘤（Hodgkin’s lymphoma,HL）、伯基特淋巴瘤（Burkett’s lymphoma,BL）以及弥漫大B细胞淋巴瘤（Diffuse
背景:细菌性肺炎在全世界占有较高的死亡率和发病率。尽管有效的抗生素和疫苗已经研发出来,但大量易感人群仍面对细菌性肺炎感染风险。肺炎链球菌（Streptococcus pneumoniae）是儿童社区获得性肺炎最常见的细菌病原体,新生期肺炎链球菌肺炎（Streptococcus Pneumoniae Pneumonia,S.pp）是发展中国家5岁一下儿童发病率和死亡率的主要原因[1],虽然对于肺炎链