嗜盐古菌Haladaptatus paucihalophilus中抗生素资源的基因组发掘

来源 :兰州大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:godchrist
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在极端环境中生存的古菌所蕴藏的抗生素资源一直以来少有发现,目前已经发现的几种(如嗜盐菌素,Halocin)也没有确定其具体结构。本文从一株嗜盐古菌Haladaptatus paucihalophilus的全基因组序列分析出发,首次发现其基因组中含有潜在的II型羊毛硫肽(Lanthipeptides)脱水环化酶基因HapM和四个前体肽合成的基因(HapA1、HapA2、HapA3和HapA4),这说明该株嗜盐古菌具有产生羊毛硫肽类化合物的潜力。经初步发酵原始菌株,结果显示这四个羊毛硫肽化合物的产量较低,目前无法从发酵液中大量得到。为了得到这四个化合物,我们利用分子克隆的方法将四个前体肽基因和脱水环化酶基因连入表达载体中,通过大肠杆菌中的异源表达,再经过纯化和脱盐等实验步骤,最终成功得到了四个经脱水环化酶HapM修饰过的化合物(HapA1、HapA2、HapA3和HapA4)。在体外用胰蛋白酶(Trypsin)将前体肽的前导肽序列切除后,经过HPLC、LC-MS、MALDI-TOF等分析,我们初步得到了四个终产物分子量的部分数据,这为确定各自的结构提供了一定的数据支持。我们用这四种产物做了相关的抑菌活性实验,结果显示在这四个化合物中,HapA2和HapA3具有良好的抗耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA,Methicillin-resistant Staphylococcus aureus)活性。经过分析,我们发现修饰酶HapM是一个在N端具有脱水功能、在C端具有环化功能的双功能酶,并对其进行了过量表达且成功得到了这个酶,为研究其新型的催化机制奠定了基础。从古细菌Haladaptatus paucihalophilus中发现抗生素,这说明在生物进化的早期,自然界就已经有了抗生素的存在,这为研究生命的起源、进化以及抗生素的起源等问题提供了重要的信息。我们得到的化合物HapA2和HapA3具有良好的抑菌活性,可作为药物发展的前体。而对脱水环化酶HapM详细功能的解析也必将丰富这类酶的催化机理,同时为这类化合物的组合生物合成研究,提供了重要的理论支撑。
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