用16S rDNA的扩增、克隆和序列分析技术,对10份喜马拉雅旱獭的胃壁菌群进行分析,发现喜马拉雅旱獭的胃壁菌群以乳杆菌为主,占菌群结构的37%,其次为牛链球菌、肠杆菌、梭菌、葡萄球菌等,分别占菌群结构的11.9%、9.0%、3.9%、3.1%。通过对100份胃壁组织进行优势菌群的分离培养,我们得到的结果是：乳杆菌58株、黄单胞菌9株、埃希氏菌8株、芽孢杆菌5株、拟杆菌4株、分支杆菌4株等。分离培养阳性率与16S rDNA克隆结果基本相符。通过设计螺杆菌属特异性引物,对鼠疫菌PCR检测阴性的200份早獭胃壁标本和100份旱獭粪便标本,进行螺杆菌筛查。结果显示：胃壁和粪便螺杆菌属特异性引物阳性标本分别为11份和19份；阳性率分别为5.5%和19%。11份螺杆菌PCR阳性胃标本对应旱獭的粪便标本全部阳性,另有8份粪便螺杆菌PCR阳性的,而其宿主的胃标本螺杆菌PCR阴性。使用35℃低氧（5%H2,5%C02,90%N2,约残留0.5%的02）的环境,在BHI+8%羊血平板或karmalia+8%羊血平板（含甲氧苄啶、万古霉素、多粘菌素B三种抗生素）,并结合0.45μm的无菌滤器,成功从胃壁及粪便标本培养出三株螺杆菌。经16S rDNA克隆序列分析、螺杆菌系统生化、电镜观察,表型实验及保守基因进化分析显示,该三株螺杆菌均为一种新种螺杆菌,是螺杆菌家族的一个新成员。根据国际新种微生物的命名规则,我们建议命名为喜马拉雅螺杆菌（Helicobacterhimalayana sp.nov.）。应用脉冲场凝胶电泳（PFGE）对三株不同来源的喜马拉雅螺杆菌进行同源性分析,结果显示三株螺杆菌同源性有较大差别。通过对新种螺杆菌进行全基因测序和相关毒力基因序列分析显示,喜马拉雅螺杆菌全长1,829,936bp,GC含量为39.89%。毒力基因分析显示该螺杆菌基因组不含尿素酶基因,但携带细胞肿胀毒素基因（cdtB）、唾液酶酸合成酶基因（neuB）、丝氨酸蛋白酶（htrA）、鞭毛（Flagella）等毒力相关基因。全基因组进化分析显示,该新种螺杆菌在进化树中,呈独立分支,与同性恋螺杆菌及肝螺杆菌亲缘关系较近。其中毒力基因cdtB为同性恋螺杆菌、肝螺杆菌及肠胃炎螺杆菌等致病性螺杆菌共有的毒力基因。该螺杆菌对人类是否具有致病性,有待于进一步研究证实。