中小企业是大众创业、万众创新的主体。目前我国企业中99%属于中小型企业,数量庞大,对我国经济的贡献占GDP总额的60%,发展潜力巨大。但中小企业由于各种资源有限,缺乏专业财会人员,内部控制不健全,因此兼任公司主要管理者的大股东可以利用拥有的权力,通过各种手段侵占公司资金,严重影响企业的长远发展。我国审计市场有近63%的审计对象是中小企业,占审计业务总量的73%,因此能否保证中小企业审计质量对事务所开展中小企业审计业务具有重要作用,针对中小企业关联方资金占用审计的详细研究具有深刻的理论和现实意义。本文利用我国中小企业相关数据,在已有文献的基础上研究总结关联方资金占用审计存在的问题,选取JH公司案例,对中小企业关联方资金占用审计进行研究。JH公司关联方资金占用是实际控制人出于自利目的,利用JH公司资金为其全资公司提供资金支持。实际控制人通过虚构采购交易、不公允价格交易、代付款、关联担保的手段以实现向关联方提供资金的目的。对会计师事务所在审计工作中存在的问题进行梳理分析后,发现其最主要的问题是关联方资金占用审计重点不明确,关联方关系识别不到位,往来款分析程序不到位以及业务质量控制流于形式。对上述问题进行原因分析后,发现外部审计的固有限制、审计资源分配不均、审计报告的及时性和成本效益冲突是问题发生的主要原因。基于以上分析,针对性的提出提高审计质量的对策建议,包括明确关联方资金占用审计的重点,设计和实施更为有效的关联方资金占用审计程序和严格关联方审计业务的质量控制复核等。综合来看,中小企业的审计难度并不低。关联资金占用以侵占企业资源的形式较为复杂且隐蔽性较高,因此事务所在进行中小企业的关联方资金占用审计时应格外关注审计重点的选择和审计程序的运用。由于作者自身实践经验有限,提出的加强关联方资金占用审计的对策建议是否切实可行还需进一步检验。