自新三板成立至今,截至2017年2月1日,新三板挂牌企业总数10454家,其中基础层9503家,创新层951家,做市转让1640家,协议转让8814家,新三板已成为全球挂牌数量最多的交易场所,其挂牌企业数量也在不断增加,在新三板高速发展的同时,其估值等方面的问题正在不断体现。本文从新三板特性、企业发展的情况、以及传统估值方法着手,主要分析挂牌企业在估值方面暴露的问题,运用不同的估值分析方法进行比较,最终选择实物期权法作为新三板企业估值方法,并以实证进行检验,实物期权法不同于传统的估值方法,将企业的发展考虑在内,故比较适合于发展潜力巨大但并不稳定的新三板,本文将在实物期权法的基础上将一些要素进行修正,使得该模型更加的适用于新三板互联网企业,因新三板发展速度较快,信息披露较不完善,数据的采集比较困难,故本文只针对新三板互联网企业进行分析与比较,往往新三板上的互联网企业较主板有很大的折价,在运用实物期权法后,新三板互联网企业的估值与主板市场较为接近,再通过一定的修正之后,使得新三板互联网企业的价值能够更好的被发掘,同时实物期权法的模型被证明能够作为议价工具运用于新三板。