1.贮藏前的农业技术措施
　　1.1品种的选择 辣椒的种类很多，多以甜椒、油椒耐贮，尖椒不耐贮。一般以角质层厚、肉质厚、色深绿、皮坚光亮的晚熟品种较耐贮藏。
　　1.2加强栽培管理 采前因素对果实耐贮性、抗病性有很大影响。果实采收后的生理状态包括耐贮性和抗病性，是在田间生长条件下形成的。果实的生育特性、田间气候、土壤条件和管理措施等，都会对果实的品质及贮藏特性产生直接或间接的影响。
　　1.3选择适宜采收期 辣椒果实的成熟度与耐贮性有很重要的关系。长期贮藏应选择果实已充分膨大，营养物质积累较多，果肉厚而坚硬，果面有光泽尚未转红的绿熟果；色浅绿，手按较软的未熟果及开始转色或完熟的果实均不宜长贮；已显现红色的果实，由于采后衰老很快，也不宜长期贮藏；采收季节对耐贮性也很重要，晚秋果最耐贮藏。选择晚秋果贮藏，还要重视收获时期的天气变化，选择连续晴天的日子采收。秋收果要在霜前收，受霜冻或冷害的辣椒不能用于贮藏或长途运输。秋后的拉秧果不耐贮藏。
　　1.4入贮前精选果实 辣椒采收时应选择充分膨大、果肉厚而坚硬、果面有光泽、健壮的绿熟果。剔除病、虫、伤果，采收要卫生、精细，避免摔、砸、压、碰撞以及因扭摘用力造成损伤。挑选、装运过程中注意避免机械伤。
　　2.贮藏的基本条件
　　2.1温度 控制温度是辣椒贮藏的基本条件。贮藏适温为9℃～12℃。一般夏季辣椒的贮藏适温为10℃～12℃，冷害温度9℃；秋季的贮藏适温为9℃～11℃，冷害温度8℃。采用双温（两段温度）贮藏，将会使辣椒贮藏期大大延长。
　　2.2湿度 保证湿度也是辣椒贮藏的重要条件。辣椒贮藏适宜的相对湿度为90％～95％。辣椒极易失水，湿度过低会使果实失水、萎蔫，采用塑料密封包装袋可以很好地防止失水。但另一方面，辣椒对水分又十分敏感，密封包装中湿度过高，出现结露，会加快病原菌的活动，促病害的发生。
　　2.3气体 应用气调贮藏是提高辣椒保鲜效果的好方法。辣椒气调贮藏适宜的气体指标一般为氧气2％～7％，二氧化碳1％～2％。包装内过高的二氧化碳积累会造成萼片褐变和果实腐烂。目前，国内外多采用PVC或PE塑料小包装进行气调冷藏，但贮藏中二氧化碳浓度往往偏高，需用二氧化碳吸收剂降低浓度。
　　2.4防腐 辣椒贮藏必须做好防腐处理，否则将会造成果实大量腐烂。辣椒的防腐处理分为两个时段，一是采前10～15天之间的果实防腐，二是采后入贮贯穿整个贮藏期的防腐。辣椒的防腐部位主要集中在果梗和果实受伤部位。
　　3.贮藏方式和管理措施
　　3.1贮藏方式 辣椒的民间贮藏方式很多，如缸藏、沟藏、窖藏等，这些方式主要是利用秋冬自然低温和一些简单的设施进行贮藏，简便易行、成本低廉。但受地区和季节的限制，一般仅适于一家一户的小规模贮藏。近年来，节能微型机械冷库贮藏以及透气膜小袋自发气调贮藏等新技术逐渐发展起来，这些方式由于能够较好地控制温度、湿度和气体等条件，不受季节和地区的限制，贮藏效果好。
　　3.2管理措施 选择防腐保鲜剂；选择简易气调保鲜膜；采前喷一次防腐药剂；适时采收，注意采前农业技术措施；贮前窖库消毒；及时入贮；合理摆放；温度管理；湿度管理；简易气调管理；防腐保鲜剂的合理使用。
　　4.贮藏时期主要病害及防治措施
　　4.1贮藏期的主要病害 辣椒灰霉病病斑多发生在果实肩部，发病初期在果实表面出现水浸状灰白色褪绿斑，随后在其上面产生大量土灰色粉状物；辣椒根霉腐可引起果实软烂，病菌从果梗切口处侵入，病果多从果柄和萼片处开始腐烂，并长出污白色粗糙疏松的菌丝和黑色小球状孢子囊；辣椒果腐病是在果面产生圆形或近圆形凹陷斑，有清晰的边缘，病斑上生有绒毛状黑色霉层；辣椒软腐病，发病初期产生水浸状暗绿色斑，后变为褐色，有恶臭味。
　　4.2贮藏期病害的防治措施 采后贮藏病害与田间病害是同一病原菌的病害，如灰霉病、果腐病、疫病、炭疽病和软腐病等。病害发生地块的果实往往带有大量病菌，或在田间就已感病，这种果实在采收之后会大量发病；根霉腐烂等在田间不致病，只在采后引起腐烂的病害，病原菌在田间也可大量繁殖。很多病原菌是在果实有伤口时才能侵入，因此避免机械损伤是有效的防病措施之一。采收时用剪子或刀片剪断果柄，使切口平滑整齐，容易愈合，可减轻发病。