【摘 要】
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目的：研究胃癌中环状RNA hsa＿circ＿0003071的基本特征、功能预测及生存预后分析。方法：通过PCR扩增验证胃癌与癌旁组织中hsa＿circ＿0003071的表达量，利用PCR扩增及一代测序验证hsa＿circ＿0003071反向剪接位点，利用核糖核酸酶R（RNase R）处理，细胞质细胞核RNA分离和定量PCR以及蛋白质翻译的潜能分析研究hsa＿circ＿0003071的基本特征。利
【机 构】
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广州医科大学附属第五医院肿瘤科广州市加速康复腹部外科重点实验室
【基金项目】
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广州市加速康复腹部外科重点实验室项目（201905010004）；
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目的：研究胃癌中环状RNA hsa＿circ＿0003071的基本特征、功能预测及生存预后分析。方法：通过PCR扩增验证胃癌与癌旁组织中hsa＿circ＿0003071的表达量，利用PCR扩增及一代测序验证hsa＿circ＿0003071反向剪接位点，利用核糖核酸酶R（RNase R）处理，细胞质细胞核RNA分离和定量PCR以及蛋白质翻译的潜能分析研究hsa＿circ＿0003071的基本特征。利用生信方法预测hsa＿circ＿0003071上微RNA（miRNA）的结合位点以及miRNA的靶基因，并构建circRNA-miRNA-mRNA网络，随后利用基因本体论（GO）及京都基因和基因组百科全书（KEGG）对miRNA的下游靶基因合集进行功能注释。结合生信方法获得hsa＿circ＿0003071调控的下游关键靶基因在胃癌的生存预后分析。结果：PCR实验证实胃癌中hsa＿circ＿0003071的表达量显著低于癌旁组织。CircBase注释显示hsa＿circ＿0003071是由基因SPATS2L转录本NM＿001100422中第6号外显子经反向剪接构成，并且PCR扩增和一代测序共同验证了hsa＿circ＿0003071的反向剪接位点。hsa＿circ＿0003071可以抵抗RNase R处理，并且主要分布于细胞质。蛋白质翻译分析显示，hsa＿circ＿0003071具有翻译蛋白的潜能，其开放阅读框可能编码含124个氨基酸的蛋白质。生信预测显示hsa＿circ＿0003071具有多个miRNA结合位点，取数据库交集的两个miRNA（has-miR-604、has-miR-1205）预测其下游靶基因共148个，随之构建circRNA-miRNA-mRNA调控网络。GO分析结果显示，上述靶基因合集分别在12个生物学过程条目和2个分子功能条目中显著富集；KEGG通路分析结果显示，上述靶基因合集在mRNA监测通路和Hippo信号通路显著富集。结论：本研究分析了胃癌中新型环状RNA hsa＿circ＿0003071的表达量、反向剪接位点、RNase R酶的抵抗性和主要分布在细胞质等基本特征，从蛋白质翻译、circRNA-miRNA-mRNA调控网络和环状RNA下游调控关键基因在胃癌中的预后生存分析角度为hsa＿circ＿0003071的功能研究提供了新的方向。
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