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目前，养蜂者主要面对的问题之一是东方蜜蜂微孢子虫（Nosemaceranae）。这种蜜蜂病原仅最近在美国蜜蜂被描述，虽然有来自存档的蜜蜂样本的新数据表明，它们在美国蜂群中至少已存在20年。或许更有利害关系的是，东方蜜蜂微孢子虫现在是感染美国蜜蜂的主要微孢子虫，而不是以前尽人皆知的西方蜜蜂微孢子虫（Nosemaapis）。西方蜜蜂微孢子虫时常被认为是越冬蜂最大的问题，尤其在冬季长而寒冷的地区。