为了研究电子束辐照处理对麦冬、大黄饮片灭菌的工艺及效果，以麦冬、大黄饮片为材料，研究不同剂量（0、2、4、6、8 kGy）电子束辐照对其微生物总数、理化指标、指纹图谱相似度及有效成分含量的影响。根据不同堆码厚度、辐照方式计算剂量不均匀度，优化麦冬、大黄饮片的电子束辐照加工工艺。结果表明，电子束辐照能明显降低麦冬、大黄饮片中的微生物数量；电子束辐照对麦冬饮片水分、水溶性浸出物及总灰分含量的变化无显著影响（P＞0.05）;电子束辐照有利于提高大黄饮片水溶性浸出物含量，对其干燥失重、总灰分变化无显著影响（P＞0.05）;辐照前后麦冬、大黄饮片的指纹图谱相似度均大于0.99,相对保留时间（RSD）均小于0.5%;不同剂量电子束辐照对麦冬、大黄饮片有效成分含量均无显著影响（P＞0.05）;剂量不均匀度与产品堆码厚度及辐照方式密切相关。综上，麦冬饮片适宜辐照剂量为2～8 kGy,大黄饮片适宜剂量为4～8 kGy,此剂量范围对麦冬、大黄饮片整体质量无显著影响。单面辐照时，麦冬饮片适宜堆码厚度为4 cm,大黄饮片适宜堆码厚度为4～6 cm;双面辐照时，麦冬饮片适宜堆码厚度为10 cm,大黄饮片适宜堆码厚度为14 cm。本研究为麦冬、大黄加工贮藏及电子束辐照在中药中的应用提供了理论依据与技术支持。