【摘 要】
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目的研究广西艾滋病病毒1型流行株的亚型及env基因C2V3区序列变异特征。方法 2009-2012年共收集138份广西HIV-1感染者血浆样本,提取病毒RNA,用巢式聚合酶链反应对env基因C2V3
【机 构】
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广西医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室,广西艾滋病防治研究重点实验室,
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目的研究广西艾滋病病毒1型流行株的亚型及env基因C2V3区序列变异特征。方法 2009-2012年共收集138份广西HIV-1感染者血浆样本,提取病毒RNA,用巢式聚合酶链反应对env基因C2V3区序列进行扩增,并测序,用MEGA、Hy Phy等软件对序列信息进行分析。结果 138份样本中,CRF01_AE亚型72例;CRF08_BC亚型40例;B亚型13例;CRF07_BC亚型8例;C亚型2例。各亚型基因离散率分别为:CRF01_AE(0.052±0.053);CRF08_BC(0.044±0.048);CRF07_BC(0.030±0.041);B亚型(0.024±0.044)。各亚型之间基因离散率差异无统计学意义(F=1.260,P=0.291)。CRF01_AE的负向选择压力比CRF08_BC大(t=10.060,P<0.001)。共发现7种V3环顶端四肽,其中CRF01_AE有6种,CRF08_BC亚型有2种,两者均以GPGQ为主;B(B’)亚型有2种,以GPGR为主,CRF07_BC仅出现了1种。在CRF01_AE亚型和B亚型中分别发现了新的V3环顶端四肽GPGM和GTGR。各亚型辅助受体均主要为CCR5。结论 CRF01_AE亚型在广西HIV-1流行株中占优势,其V3环顶端四肽以GPGQ为主。CRF01_AE亚型和B亚型V3环序列出现了新的变异特征。广西HIV-1流行株主要为巨噬细胞嗜性的非合胞体诱导型。
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