系统进化树在行维持性血液透析患者丙型肝炎病毒感染的基因型及同源性分析中的应用

来源 :上海医学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:arsonloupeen
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的明确行维持性血液透析(MHD)患者丙型肝炎病毒(HCV)感染的基因型及同源性,为血液透析中心HCV感染的防治提供依据。方法选择1995年1月—2013年2月在深圳市第二人民医院规律行MHD的患者183例,采用荧光定量聚合酶链反应(PCR)测定抗-HCV阳性并行MHD患者的HCV-RNA定量。对HCV-RNA定量≥1×106U/L的MHD患者,通过巢氏反转录(RT)-PCR对5’UTR及NS5B区进行扩增,扩增产物通过Sequence Scannerv1.0导出峰图,Muscle进行序列比对,MEGA5.1构建进化树以确定基因分型,Bootstrap1000检测进化树的可靠性,Blat进行序列同源性分析,以同源性>95%认为有来自同一传染源的可能。结果 183例行MHD患者中,抗-HCV阳性13例,HCV感染率为7.1%。HCV-RNA定量≥1×106U/L9例:1b型7例(患者分别记录为PC1、PC2、PBC17、PC29、PBC31、PC34、PC32),6a型2例(患者分别记录为PC11、PC20)。1b型中,PC1与PC2间的遗传距离为0.000,PC2与PBC17间的遗传距离为0.008,PC29与PBC31间的遗传距离为0.035;6a型中,PC11与PC20间的遗传距离为0.068。PC1与PC2的同源性为100%,PC2与PBC17的同源性为99.23%,PC29与PBC31同源性为96.63%,PC11与PC20同源性为93.63%。9例患者的平均感染时间为(7.9±6.1)年,平均透析时间为(7.0±3.1)年。其中,PC1、PC2、PC11、PBC17和PC20均否认有输血史,行透析治疗1~3年间发现HCV感染;PC29、PBC31、PC32和PC34均有输血史;PC2和PC11在入住深圳市第二人民医院血液透析中心前、PC29和PBC31在进行MHD前均已证实为HCV感染。结论 1b型为深圳市第二人民医院血液透析中心行MHD的患者HCV感染最常见的基因型,其次为6a型。PC1、PC2和PBC17的HCV感染为同一流行株,同源性达99%以上,确定PC2为输入性传染源。
其他文献
针对传统系统缺少最小方差估算步骤,容易受到信号干扰影响,存在预测精准度较低的问题,提出基于卡尔曼滤波的网球发球最佳击球点预测系统。根据系统硬件结构框图,设计预测感知
<正>伴随着中国经济活力不断增强,人民币国际化进程逐渐加速。不论对中国还是对世界其他国家而言,人民币离岸中心的建设能让各方都从中钓得大鱼。6月,国务院总理李克强访问英
随着社会经济的不断发展,提高物业服务工作水平已经成为社会广泛关注的议题之一。本文中,笔者首先介绍了物业服务的基本内涵,而后分析了当前物业服务中存在的问题,最后提出了
文章简要解析了就业歧视的概念与本质,分三个不同层面分析了民办高校大学生就业歧视的现状,进而从走出晕轮思维怪圈、完善与健全反就业歧视法律、强化地方政府问责和强化高校
作为一种衡量高职院校人才培养质量及学生实践动手能力的测试方式,职业技能大赛正逐渐被高职院校所重视。通过职业技能大赛,可以培养学生的创新意识、实践操作能力、奋进精神
目的:探讨迟发性羊水栓塞早期诊断及早期治疗。方法:回顾2例我院迟发性羊水栓塞尸体检查(尸检)病例,进行临床病理分析和文献复习。结果:2例均缺乏典型羊水栓塞表现,死于失血
随着微电子、通信以及计算机技术的迅速发展,智能交通领域的视频监控技术及其设备产品也不断推陈出新,传统的监控方式已不能满足日益增长的市场需求,数字化、网络化、小型化
钢筋混凝土桥梁的耐久性是结构工程领域内世界各国广为关注的问题之一。对钢筋混凝土结构进行耐久性评定和剩余寿命预测,不仅可以揭示潜在危险、及时做出维修或拆除决策,而且研
柏拉图的正义观贯穿于《理想国》一书,是其民主和法治构建理论的基础。文章通过考察柏拉图正义观提出的背景和柏拉图对当时盛行正义观的批判,阐述柏拉图正义观的内涵及其实现
建筑幕墙施工质量的好坏,直接关系到生命安全和工程质量。因此,必须以质量为中心,加强对建筑幕墙施工质量的控制。本文通过介绍建筑幕墙的结构与构造特点,分析了主要施工特点