多囊卵巢综合征颗粒细胞氧化应激相关基因及基因-转录因子调控网络

来源 :中国优生与遗传杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:shion31208
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目的 多囊卵巢综合征(PCOS)的发生发展与氧化应激密切相关。本研究旨在鉴定PCOS颗粒细胞的氧化应激相关基因及基因-转录因子网络。方法 R软件下载来自基因表达数据库(GEO)的GSE34526数据集,与氧化应激相关的基因通过Python软件在基因本体论(GO)数据库获得。对差异表达的氧化应激相关基因进行GO富集分析、京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)信号通路富集分析和蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络分析。最后,使用Network Analyst web工具查找关键差异基因的转录因子(TFs)。结果 7例PCOS患者和3例健康对照女性共检测到63个氧化应激相关差异基因。GO和KEGG富集分析显示,差异基因与肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、叉头框蛋白O(FoxO)信号通路、凋亡和氧化应激等方面有关。PPI结果显示,各基因间存在显著的交互作用。基于35个关键基因(Hub gene)中的前22个,我们发现了14个转录因子。结论 我们鉴定出63个潜在的PCOS颗粒细胞氧化应激相关基因,包括35个关键基因和14个转录因子,它们可能通过调节颗粒细胞氧化应激水平在PCOS不同表型中发挥重要作用。
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