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胃肠道黏膜有两个黏蛋白层,内层紧密而外层疏松,这两层都由大量黏蛋白(MUC2)组成。小肠病原菌通过自身运动性、黏液溶解活性和其他有害因子的毒性,削弱黏液层的保护功能,致使黏液层变薄和通透性增加,从而接触并入侵上皮细胞。黏液层在建立共生肠道菌群、防御致病微生物的移植和入侵上扮演着重要的角色。